专家们使用了一种尖端的计算方法来发现导致霍乱病菌如此危险的遗传因素,这可能是预防这种致命疾病的关键。
这项突破性研究发表在《自然通讯》杂志上,由诺丁汉大学的Tania Dottorini教授领导,与孟加拉国流行病学、疾病控制与研究所(IEDCR)、孟加拉国国际腹泻病研究中心和南北大学合作。
这项创新研究结合了机器学习、基因组学、基因组规模代谢模型(GSMM)和3D结构分析,以揭示霍乱弧菌的遗传秘密。
霍乱是一种致命的腹泻疾病,继续威胁着全世界数百万人,每年有多达400万例病例,死亡人数多达14.3万人。仅在霍乱持续存在危险的孟加拉国,就有6600万人面临危险,每年有10万多例病例和4 500人死亡。
霍乱弧菌的进化方式使疾病更加严重,更难控制,但直到现在,科学家们一直在努力查明驱动这些变化的确切遗传因素。
对这些谱系导致霍乱严重程度的基因组特征的了解甚至更少。大约五分之一的霍乱患者会由于一系列症状(主要是腹泻、呕吐和脱水)而出现严重症状。
在这项新研究中,英国-孟加拉国研究小组分析了孟加拉国六个地区霍乱患者的细菌样本,这些样本收集于2015年至2021年之间。他们在导致2022年毁灭性疫情爆发的最新和主要霍乱弧菌菌株中发现了一组独特的基因和突变。
这些遗传特征与这种细菌引起严重症状的能力有关,比如长时间腹泻、剧烈腹痛、呕吐和脱水——严重时这些症状可能导致死亡。
多托里尼教授说:“通过确定导致霍乱传播和严重程度的关键遗传因素,我们朝着开发更有效的治疗方法和有针对性的干预措施迈出了重要的一步。这可以挽救成千上万的生命,不仅在孟加拉国,而且在全球。”
研究结果还表明,这些致病特征中的一些与那些帮助细菌更容易传播的特征重叠。研究结果表明,这些遗传因素如何使霍乱弧菌在人类肠道中存活,使其更能适应环境压力,并更有效地引起疾病。这项研究强调了细菌的基因组成与其引起严重疾病的能力之间复杂的相互作用。
这个新的计算框架是抗击霍乱的重要一步。通过确定使霍乱弧菌更危险的关键遗传因素,科学家可以开发更好的治疗方法和更有针对性的策略来控制和预防未来的疫情。这一突破为改善孟加拉国的公共卫生带来了新的希望,并有可能挽救全世界无数人的生命。
Dottorini博士补充说:“我们的发现为霍乱研究的新时代打开了大门,在那里我们可以开发工具来预测和潜在地预防严重的疫情发生。最终目标是将这些见解转化为保护弱势群体的现实解决方案。
“只有通过英国和孟加拉国合作伙伴的密切合作,这一突破才有可能实现。我们将尖端的计算工具与当地的专业知识结合起来,共同应对最紧迫的公共卫生挑战之一。”
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